sleep_ts = authd_client.time_series('sleep/minutesAsleep',period='3m')
data = sleep_ts['sleep-minutesAsleep']

csv_file = open("sleep_csv","w")
for s in data:
    csv_file.write(s['dateTime'])
    csv_file.write(',')
    csv_file.write(s['value'])
    csv_file.write('\n')
csv_file.close()

で、3ヶ月分の時系列がとれました！

2. データの整形

週次の睡眠時間を集計します。
データを眺めてみます

2016-09-27,0
2016-09-28,318
2016-09-29,325
2016-09-30,372
2016-10-01,376
2016-10-02,341
2016-10-03,0
2016-10-04,281

のように、データがとれていない日があり、0が入っています。
（なお充電しっぱなしで寝落ちしたり、風呂あがりに付けるの忘れたとかです）
なので、欠損値をとばす必要があります。
pandasを使うと便利です。

import pandas as pd

df = pd.read_csv('./sleep_csv',names=['date','asleep'],na_values='0')
df = df.dropna()

na_valuesで0を欠損値として、dropnaで欠損値ありの行を落とすとうまくいきます。

3. データの集計

これもpandas先生におまかせ。

idx = pd.to_datetime(df['date'])
ts = pd.Series(df.asleep.values,index=idx)
ts_r = ts.resample('W', how='mean', kind='period')

で週単位に集計できますね。

4. 眺める

描画部分は、コードを略します。結果はこんな感じ
いまさらながら折れ線グラフはよくないですね。（欠損値のところに線がひかれてしまったり）
日別の睡眠時間
週別の平均睡眠時間
直近死に絶えていたのは、実際に正しかった。
ただ、休日夜更かししたのと、平日寝れていないのの区別が難しい。
10月9日は多分単なる夜更かし。ただ、月曜のストレスで日曜ねれないとかもあるので、難しい。

まとめ

pandas先生便利。

参考

上記のリンク元の文書に加え、データ処理に関し

ITエンジニアのためのデータサイエンティスト養成講座（4）：ログを分析するには？ XMLデータを分析するには？ pandasでデータを分析できる状態にする (1/3) - ＠ITを参考にしました。

2016-12-10

ウェアラブル的に一年を振り返る（その１）

いつものまえがき

この記事はぴょこりんクラスタ:Re Advent Calendar 2016 - Adventarのために書かれました。

サマリ

fitbitHRに貯めこまれたデータから、記憶を蘇らせたかった。
睡眠時間の推移からつらみを蘇らせたかった。
が、休日出勤により私のライフと作業時間が０に漸近して撃沈した。

やったこと

fitbitHRのデータは、

https://dev.fitbit.com/jpにある、fitbit APIから取ってくる。
登録して、ConsumerIDとKeyを取得。

APIのpythonクライアント実装

github.com
をcloneして、python build,install, requirementpackageのインストール

とりあえず、documentationhttp://python-fitbit.readthedocs.io/en/latest/の通り、先に、gather_keys_oauth2.pyを叩いてaccess_token,refresh_tokenを取得。

めんどくさいので、もろもろをソースに埋め込み（だめです・・・）実行。認証も通り、データコレクションが取れた！！

とりあえず、sleepをみてみると、summaryってところに、一日睡眠時間が入っていそう

よし

authd_client = fitbit.Fitbit(CLIENT_ID,CLIENT_SECRET,access_token=ACCESS_TOKEN,refresh_token=REFRESH_TOKEN)
print authd_client.sleep()['summary']

{u'totalTimeInBed': 379, u'totalMinutesAsleep': 348, u'totalSleepRecords': 1}

これ、今日の睡眠時間しかないな・・・（←イマココ）意外と寝れたな…ってちがう。

まとめ

APIとデータ構造を調査する時間がほしかった。
そもそも１ヶ月とかさかのぼれるのかしらん。

2016-12-05

今年の振り返り（漫画編）

本記事はぴょこりんクラスタ:Re Advent Calendar 2016 - Adventarのために書かれています。

サマリ

今年読んでおすすめしたい漫画の紹介です。
いつもどおり、備忘録レベルです。

放課後さいころ倶楽部

放課後さいころ倶楽部 1 (ゲッサン少年サンデーコミックス)
- 作者: 中道裕大
- 出版社/メーカー: 小学館
- 発売日: 2013/09/12
- メディア: コミック
- この商品を含むブログ (24件) を見る
女子高生がボードゲームをします。
ボードゲームをしている描写が丁寧で、個人的に好きです（あまり手持ちのゲームとはかぶっていないですが）。
学年あがって、新メンバも増えて、今後に期待です。

ポプテピピック

ポプテピピック (バンブーコミックス WINセレクション)
- 作者: 大川ぶくぶ
- 出版社/メーカー: 竹書房
- 発売日: 2015/12/07
- メディア: コミック
- この商品を含むブログ (7件) を見る
周囲で謎の侵食を見せる漫画。
何が面白いか、言語化できないです。
意外とパロディネタが拾えないです。